基于成熟的HiSeq 2500系统，凭借创新的图案化流动槽技术，HiSeq 3000/4000系统带来了无可匹敌的速度和性能。双流动槽的HiSeq 4000系统提供了最高的通量和每个样品的最低价格，适合广泛的应用。而单流动槽的HiSeq 3000系统则享有同样的低价格和快速运行时间。

基于HiSeq 2500系统的成熟性能，并凭借超高通量 HiSeq X 系统的图案化流动槽技术，HiSeq 3000/4000测序系统带来了无可匹敌的测序速度和性能。它们提供了最高的覆盖度，出色的运行周期，以及处理多个样品的灵活性，为生产规模级基因组学实验室提供了一个完整的方案。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统带来了最高的单日测序通量和每个样品的最低价格，适用于广泛的应用，也成为开展各种基因组应用的高通量实验室的理想选择。HiSeq 4000系统能够在3天内测序12个基因组、100个转录组，或180个外显子组。这种无可匹敌的能力意味着更多样品以更高的深度同时并行测序，产生更加丰富、更有意义的数据。

双流动槽的HiSeq 4000系统能够平行处理一个或两个流动槽，带来最大的数据输出和最高的单日测序通量，其每次运行能够产生1.5 Tb (terabases)和50亿条序列。HiSeq 3000系统的每个流动槽产量与HiSeq 4000系统相同，但每次只能处理一个流动槽，故每次运行能带来750 Gb和25亿条序列。当通量需求增加时，HiSeq 3000系统也能升级到HiSeq 4000系统。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统利用了Illumina所有NGS（新一代测序）系统所使用的可逆终止子边合成边测序(SBS)化学法。SBS提供了卓越的数据质量，是行业中采用最广泛的测序方法。凭借在HiSeq X Ten系统中首次使用的图案式流动槽创新技术，HiSeq 3000/HiSeq 4000系统带来了非凡的测序通量。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统与云端的BaseSpace基因组学计算环境相整合，后者能提供简单、可扩展的数据分析和存储。BaseSpace环境包括通过苹果商店访问第三方应用程序，用于下游分析。BaseSpace计算特有实时的数据上传、比对和变异检出，运行监控，以及与世界上任何人即时共享数据的选项。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统带来了最高的单日测序通量和每个样品的最低价格，适用于多个应用、物种和样品类型，为生产规模级测序实验室提供了一个理想的方案。

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统让快速、经济高效且大规模的全基因组测序就在您的实验室中实现，这样就能够：
• 在HiSeq 3000系统的每次运行中最多测序6个人类全基因组（30倍覆盖度），且时间不到3天
• 在HiSeq 4000系统的每次运行中最多测序12个人类全基因组（30倍覆盖度），且时间不到3天

HiSeq 3000/HiSeq 4000系统和Nextera Rapid Capture Exome Kits实现了高通量、生产规模级全外显子组测序，为研究外显子组提供了一个全面、准确而经济的方案。如今就能够:
• 在HiSeq 3000系统的每次运行中最多测序90个外显子组（假定每个外显子组4 Gb）
• 在HiSeq 4000系统的每次运行中最多测序180个外显子组（假定每个外显子组4 Gb）

从高通量的基因表达谱分析到深度的转录分析，HiSeq 3000/HiSeq 4000系统为高通量的RNA分析提供了前所未有的方案。测定单个转录本和异构体的丰度，发现新的基因，和鉴定非编码调控RNA。这些系统能够: 
• 在HiSeq 3000系统的每次运行中最多测序50个人类全转录组（假定每个样品5000万条序列）
• 在HiSeq 4000系统的每次运行中最多测序100个人类全转录组（假定每个样品5000万条序列）

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